Seit 2010 ist Mark Kölliker Dozent für Chorleitung an der Hochschule für Musik Lugano. Dort betreut er eine Klasse von Masterstudierenden in Chordirigieren und leitet den Chor und Vokalensembles der Hochschule.
Ebenso seit 2010 ist er künstlerischer Leiter des Chœur de Chambre Jurassien, der unter seiner Leitung den ersten Preis beim Schweizer Chorwettbewerb gewann. 
Er studierte zunächst Schulmusik II, mit den Schwerpunkten Klavier, Gesang und Dirigieren bei Prof. Raphael Immoos an der Hochschule für Musik Basel und vertiefte seine dirigentische Ausbildung durch ein Aufbaustudium für Chor-und Orchesterdirigieren an der Hochschule für Musik und Darstellende Kunst Mannheim unter Prof. Georg Grün, Prof. Klaus Arp und Prof. Mario Venzago.

Meisterkurse führten ihn zu Pierre Boulez, Bernhard Haitink, Silvain Cambreling, Peter Eötvos, Zolt Nagy, Uwe Gronostay, Gary Graden, Wolfgang Schäfer, Peter Gülke, Dan-Olav Stenlund, Andrew Parrot, Johannes Schlaefli, Kirk Trevor, Tsung Yeh, Larry Rachleff, Mnozil Brass und dem Dirigentenforum des Bayerischen Rundfunks.

Er arbeitete u.a. mit bekannten Sängerinnen und Sängern wie Julian Prégardien, Nuria Rial, Alice Rossi, Maria Bernius, Miriam Feuersinger, Jakob Pilgram, Hans-Jürg Rickenbacher, Raphael Höhn, Markus Volpert, Ralf Ernst, Marc-Olivier Oetterli, Katharina Persicke, Lydia Teuscher, Georg Gädker und Silvia Hauer.

Mark Kölliker assistierte Mario Venzago bei verschiedenen Produktionen des MDR-Rundfunkorchesters und Rundfunkchors in Leipzig, des Sinfonieorchesters und Sinfonischen Chores Malmö, der Heidelberger Philharmoniker und des Sinfonieorchesters Basel.

Er dirigierte u.a. die Südwestdeutsche Philharmonie Konstanz, Baden-Badener Philharmonie, Württembergische Philharmonie Reutlingen, Sinfonieorchester Malmö, Janacek Philharmonie Ostrava, Camerata Stuttgart, Kammerphilharmonie Mannheim, Plovdiv Philharmonic Orchestra, Bohuslav Martinu Philharmonie, Ensemble Incontro Mannheim, Capriccio Barockorchester Basel, Niederbayrisches Kammerorchester und das Akademische Orchester Basel.

Auch als Ensemblesänger war er in mehreren professionellen Ensembles tätig wie den Basler Madrigalisten, dem Schweizer Kammerchor, dem Ensemble Cantissimo, den Basler Vokalsolisten und singt seit 2005 im Kammerchor Saarbrücken.

An der Hochschule für Musik Basel war er mehrfach als Gastdozent tätig und ist Experte bei Chorleitungsdiplomen.